Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LAMA3Q16787 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms