Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMCO1Q147U7 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms