Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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GPS1Q13098 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GPS1Q13098 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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