Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BNIP1Q12981 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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BNIP1Q12981 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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BNIP1Q12981 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP1Q12981 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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