Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NEDD9Q14511 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NEDD9Q14511 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms