Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ATRQ13535 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATRQ13535 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATRQ13535 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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