Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
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GEN1Q17RS7 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
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