Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
STRN3Q13033 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms