Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRDP23468 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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PTPRDP23468 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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PTPRDP23468 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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PTPRDP23468 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
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