Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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