Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM3DQ96BQ1 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms