Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms