Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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VAMP3Q15836 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VAMP3Q15836 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
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VAMP3Q15836 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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VAMP3Q15836 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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VAMP3Q15836 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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