Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BPQ13352 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms