Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms