Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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LAMA3Q16787 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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