Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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