Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CEP290O15078 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CEP290O15078 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CEP290O15078 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CEP290O15078 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CEP290O15078 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CEP290O15078 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CEP290O15078 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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CEP290O15078 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CEP290O15078 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CEP290O15078 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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