Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms