Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
LAMA3Q16787 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
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