Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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TUBB3Q13509 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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