Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SKP2Q13309 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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