Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CENPEQ02224 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms