Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
B4DXG7 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
B4DXG7 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms