Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZNF239Q16600 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZNF239Q16600 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZNF239Q16600 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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ZNF239Q16600 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ZNF239Q16600 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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