Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK5Q16478 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK5Q16478 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GRIK5Q16478 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GRIK5Q16478 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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GRIK5Q16478 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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