Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PDE6HQ13956 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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