Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms