Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms