Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TRERF1Q96PN7 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TRERF1Q96PN7 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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