Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ZBED9Q6R2W3 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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