Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZIC1Q15915 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms