Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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