Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PSME4Q14997 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms