Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
XRCC4Q13426 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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