Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROQ12816 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROQ12816 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TROQ12816 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROQ12816 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TROQ12816 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TROQ12816 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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