Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SYPL1Q16563 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms