Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF56Q15929 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF56Q15929 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF56Q15929 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF56Q15929 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF56Q15929 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms