Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZFHX3Q15911 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ZFHX3Q15911 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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