Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SHPRHQ149N8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SHPRHQ149N8 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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SHPRHQ149N8 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SHPRHQ149N8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SHPRHQ149N8 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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