Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CTTNQ14247 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms