Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PEX6Q13608 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms