Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
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CALCOCO2Q13137 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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