Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GABRA6Q16445 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms