Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMC1AQ14683 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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