Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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IFT88Q13099 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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