Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
BPTFQ12830 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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