Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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