Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Speer3W4VSP1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer3W4VSP1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms