Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vstm4T1NXB5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms